PREDIKSI ADMET DAN MOLECULAR DOCKING METABOLIT SEKUNDER CENTELLA ASIATICA SEBAGAI CALON ANTIKANKER PAYUDARA

Farah Fadhilah Faza; Dini Kesuma; Azminah

doi:10.36423/pharmacoscript.v7i1.1413

Authors

Farah Fadhilah Faza Universitas Surabaya
Dini Kesuma Universitas Surabaya
Azminah Univesitas Surabaya

DOI:

https://doi.org/10.36423/pharmacoscript.v7i1.1413

Keywords:

Centella asiatica, kanker payudara, in silico

Abstract

Kanker payudara merupakan penyakit yang ditandai oleh pembelahan sel payudara yang tidak terkendali, karena mutasi atau perubahan abnormal. Doxorubicin adalah agen kemoterapi standart untuk kanker payudara, namun memiliki efek samping dan dapat menyebabkan resistensi obat. Pemanfaatan bahan alam Indonesia dapat digunakan sebagai sarana pengobatan alternatif/komplementer, dengan keunggulan efek samping relatif kecil dibanding bahan kimia sintetis. Centella asiatica adalah salah satu tanaman yang dapat dimanfaatkan untuk pengobatan tradisional antikanker. Dalam pengembangan dan penemuan obat baru membutuhkan biaya yang besar, waktu yang lama serta tenaga yang banyak karena perlu dilakukan uji coba dan sintesis pada sebagian besar prosesnya tanpa adanya desain atau alasan yang jelas. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui aktivitas sitotoksik metabolit sekunder Centella asiatica, secara in silico. Pengujian yang dilakukan adalah prediksi sifat fisikokimia druglikeness, ADME-Tox, serta molecular docking metabolit sekunder dan obat pembanding Doxorubicin terhadap target reseptor SIRT1 (kode PBD: 4I5I.pdb) mengguankan program Autodock Vina. Dengan hasil energi ikatan yang lebih baik daripada obat pembanding Doxorubicin (-9,46kkal/mol), yaitu 3-O-cis-Caffeoylquercetin (-10.34kkal/mol), Quercetin (-10.28kkal/mol), dan 3-O-cis-Coumaroyl-kaempferol (-10.19kkal/mol). Maka metabolit sekunder Centella asiatica terbaik secara in sillico, yang dapat digunakan sebagai calon antikanker payudara adalah 3-O-cis-Caffeoylquercetin.

References

Global Cancer Observatory (2022, 24 Oktober). New Global Cancer Data. Diakses pada 20 Desember 2022, dari https://gco.iarc.fr/

National Health Service (2019, 13 Oktober). Overview Cancer. Diakses pada 17 November 2022 pada https://www.-nhs.uk/conditions/cancer/#:~:text=-Cancer%20treatment,of%20high%2Denergy%20X%2Drays.

Bandyopadhyay, A., Wang, L., Agyin, J., Tang, Y., Lin, S., Yeh, I.-T., De, K., & Sun, L.-Z. (2010), Doxorubicin in Combination with a Small TGFb Inhibitor: A Potential Novel Therapy for Metastatic Breast Cancer in Mouse Models. PLoS ONE, 5(4), 13. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0010365

Sieberi, B. M., Omwenga, G. I., Wambua, R. K., Samoei, J. C., & Ngugi, M. P. (2020). Screening of the Dichloromethane: Methanolic Extract of Centella asiatica for Antibacterial Activities against Salmonella typhi, Escherichia coli, Shigella sonnei, Bacillus subtilis, and Staphylococcus aureus. The Scientific World Journal, 2020.

Pittella F, Dutra RC, Junior DD, Lopes MT, Barbosa NR: Antioxidant and cytotoxic activities of Centella asiatica (L) Urb. Int J Mol Sci 2009, 10(9):3713–3721.

Jasmansyah, J., Fitriyani, P., Sujono, H., & Aisyah, L. S. (2020). Antimicrobial Activity of Essential Oil from Centella asiatica (L.) Urb Plant. Jurnal Kartika Kimia, 3(1), 43-47.a

H. Zhang, L.-Q. Zhang, C.-C. Yang, J. Li, X.-Y. Tian, D.-N. Li, J. Cui, J.-P. Cai, The high expression of NUDT5 indicates poor prognosis of breast cancer by modulating AKT/Cyclin D signaling, PLoS One 16 (2021), e0245876.

Siswandono (2016) ‘Kimia Medisinal 1 Edisi 2 - Google Books’. Available at: https://www.google.co.id/books/edition/Kimia_Medisinal_1_Edisi_2/UKbJD1

D. Kesuma, B. T. Purwanto, and M. Rudyanto, “Synthesis and anticancer evalution of N-benzoyl-N-phenyltiourea derivatives against human breast cancer cell (T47D),” J. chinese Pharm. Sci., pp. 123–129, 2020.

Lu Ren, Qin-Xue Cao, Feng-Rong Zhai, Shao-Qin Yang & Hong-Xia Zhang (2016) Asiatic acid exerts anticancer potential in human ovarian cancer cells via suppression of PI3K/Akt/mTOR signalling, Pharmaceutical Biology, 54:11, 2377-2382, DOI: 10.3109/13880209.2016.1156709.

Yasmin, R., Mafiroh W.U., Kinasih, A., Ramadhani, A.N., Putri, R., Semiarti, E. (2022). Potential of Anti-Cancer and Antimicrobial in Orchid Based on Prediction of Activity Spectra for Substances (Pass) Online. Journal of Agromedicine and Medical Sciences, 8(1), 25-33. https://doi.org/10.19184/-ams.v8i1.2684 8

Hanif, Atika Umi, Prima Agusti Lukis, Arif Fadlan (2021). Pengaruh Minimisasi Energi MMFF94 dengan MarvinSketch dan Open Babel PyRx pada Penambatan Molekular Turunan Oksindola Tersubstitusi. Alchemy: Journal of Chemistry, 8(2) 33-40.

Daina, A., Michielin, O., Zoete, V. 2017. SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Scientific Reports, 7: 1-13.

Mohammed Afroz Bakht, M. Shahar Yar, Sami Gaber Abdel -Hamid, Saleh I. Al Qasoumi, Abdul Samad, Molecular properties prediction, synthesis and anti - microbial activity of some newer oxadiazole derivatives, European Journal of Medicinal Chemistry , 45, 12, (2010), 5862 -5869 https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2010.07.069

Frengki, Saura, E.R., Rinidar. 2013. Studi interaksi kurkumin-artemisin dan turunannya terhadap reseptor sarcoendoplasma reticulum Ca2+ secara in silico. Jurnal Medika Veterinaria, 7(2): 138-141.

Yeni, Supandi, Fajar Merdekawati (2018). In silico toxicity prediction of 1-phenyl-1-(quinazolin-4-yl) ethanol compounds by using Toxtree, pkCSM and preADMET. Pharmaciana. 10.12928/pharmaciana.v8i2.9508

Baroroh Umim zahra Silmi Muscifa, Wanda Destiarani, Fauziah Giansyah Rohmatulloh, Muhammad Yusuf (2023). Molecular interaction analysis and visualization of protein-ligand docking using Biovia Discovery Studio Visualizer. Indonesian Journal of Computational Biology, 2(1), 22-30.